Једна од највећих користи јутарње гимнастике је утицај на здравље мишића, зглобова и кичме. Многи људи ујутро осећају укоченост због положаја током спавања или недостатка кретања. Неколико једноставних вежби истезања може знатно смањити тај осећај и омогућити телу да се покрене без напора. Такође, редовно јутарње вежбање може спречити болове у леђима и врату који често настају услед дуготрајног седења.
Јачање мишића кроз кратку, али редовну јутарњу активност може имати дугорочне користи. Мишићи који су снажнији боље подржавају кичму, смањују ризик од повреда и побољшавају држање. Осим тога, активност од неколико минута дневно довољна је да покрене зглобове, што доприноси њиховој флексибилности и већој издржљивости. Ове промене чине тело отпорнијим на физичке напоре током дана.
Превенција болова и укочености је један од разлога зашто стручњаци често препоручују јутарњу гимнастику као здраву навику. Уместо да дан започнемо у седентарном положају, кретање омогућава организму да функционише на природан и ефикасан начин. Такав почетак дана доноси осећај лакоће и физичке снаге која траје током целог дана.